支付宝电子医保卡不可以扣医保里面的钱。在使用支付宝电子医保卡的时候，支付宝电子医保卡只能从支付宝中扣款，或者从支付宝绑定的银行卡中扣款，是不会从医保卡中扣款的，想要从医保卡中扣款，需要使用医保卡来支付的。

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