付款时没有发票做账的做法，需要根据公司的具体财务程序和税收管理规定来进行。首先，在发出付款时，要明确付款目的，并做好收款人、账号、金额、支付方式等记录，以备后期发票出现问题时可以核实。
如果发票没有及时开出，可以将付款记录在期初上的应付凭证中，并记录付款的编号和付款原因，以及对方是否逾期开具发票的日期，以便及时发现异常情况并追加付款记录。
一般在付款时会要求对方开具发票，但每个收款方都有可能出现发票不及时开出的情况。如果收到的发票中发票号码、日期、金额不规范，出现罕见的异常情况，则需要小心查核，以确保财务准确可靠，避免因此造成损失。
拓展知识：发票是财政部门和税务部门统一管理的税费凭证，它是企业付款或收款的重要依据，具有正式书面证明企业经营收入合法性的功能，对企业财务管理有着重要的意义。要正确使用发票，企业必须遵守国家有关税收管理规定，正确处理发票、入账、出账等各方面工作，才能使企业的财务管理保持有效性、合法化，以避免由发票使用不当而带来的风险。