在同时为两家公司工作时，个人所得税的申报流程主要包括几个步骤。
首先，需要准备相关的个人所得税材料。这些材料包括来自两家公司的收入来源证明、个人主页以及其他费用证明。其中，费用证明通常指的是每月发放的工资、奖金、佣金和补贴等收入。
其次，纳税人需要准备纳税申报表。这份申报表需要按照要求填写，包括基本信息、所得项目、减免项目和纳税额等内容。
接下来，税务机关会对提交的材料进行审核和复核。在材料通过审核后，纳税人需要在有效期内缴纳个人所得税。
最后，纳税人可以选择网上缴税或者前往税务机关缴税的方式来完成个人所得税的缴纳。
此外，纳税人在申报个人所得税时，还需要注意其他税种的缴纳情况，例如增值税、营业税和房产税等。纳税人需要确保以上收入是否已经被计算在税收中。