关于苗木免税发票能否抵扣，一般情况下是可以的。因为苗木属于种植性农产品，所以按照相关政策规定，可以通过免税店等机构购买苗木，并发放免税发票。这类免税发票可以用于营改增的企业税收申报中，并能够进行抵扣。但是，要实现抵扣，必须要满足一些条件。
首先，苗木必须是购买家在营改增实施期间，按照国家税收政策的规定购买的。否则就不具备抵扣的条件。其次，苗木也必须是发票项下的报销类目。否则也不能进行抵扣。最后，抵扣时也要确保发票信息正确。以防止出现错误抵扣的情况。
拓展知识：除苗木外，农产品还包括各类粮食、果蔬、花卉、肉类、蛋类、水产品等。一般来说，这些农产品也都是可以抵扣的。但是也需要确保购买时间和发票信息正确才能够进行抵扣。