农民在税务局代开的发票是免税的，可以抵扣。这意味着，当企业向农业生产者个人购进自产农产品时，可以向主管税务局申请农副产品收购发票，或者由农业生产者去税务局申请代开免税销售发票。无论是企业自开的农副产品收购发票，还是税务局代开的免税农产品销售发票，均可以作为进项税额抵扣凭证。
除了这种方式外，还有其他几种途径可以进行增值税抵扣：
1. 一般纳税人开具的增值税专用发票：购进企业可以按规定进行抵扣，即可以按照票面注明的税额抵扣。这种抵扣方式适用于大多数企业与供应商之间的交易。
2. 海关进口增值税专用缴款书：企业购进进口原辅材料的，可以按海关进口增值税专用缴款书注明的税额进行抵扣。这种方式适用于从国外进口原材料的企业。
3. 向农业生产者购进的自产农产品：可以凭农副产品收购发票或自产农副产品销售发票抵扣进项税额。这种方式适用于那些经常从农业生产者个人处购买自产农产品的企业。
总之，企业在进行增值税抵扣时有多种选择。农民在税务局代开的发票是其中一种有效的抵扣方式，可以帮助企业降低成本，提高竞争力。