运输费的发票中，增值税的税率是按照纳税人的类型来确定的。对于一般纳税人来说，其税率为9%；而对于小规模纳税人，其征收率则为3%。
根据财税2016年36号文件附件一中的第十五条规定，提供交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权的税率为11%。然而，现行税率已经调整为9%。
此外，中华人民共和国境内的单位和个人销售的国际运输服务和无形资产，适用于增值税零税率。国际运输服务是指：在境内载运旅客或者货物出境；在境外载运旅客或者货物入境；以及在境外载运旅客或者货物。另外，航天运输服务也适用增值税零税率。
综上所述，纳税人在开具运输费发票时需要根据其纳税人类型确定适用的税率。同时，国际运输服务和航天运输服务在增值税方面享受零税率优惠。这些政策对于促进交通运输行业的发展具有积极的影响。