税务会计和财务会计虽然都依赖于财务会计数据，但它们在目标、实现方式、核算规范、核算基础、核算对象、核算程序、会计要素以及对会计稳健原则的态度上存在显著差异。
首先，税务会计的目标实现方式是纳税申报，而财务会计的目标实现方式则是提供财务报告，包括资产负债表、损益表和现金流量表。
其次，税务会计和财务会计的核算规范也不同。税务会计依据的是税收法律和法规，按照税法规定计算应纳税额并向税务部门申报。而财务会计则依据会计准则和会计制度，按照会计准则和会计制度的程序和方法组织会计核算和提供信息。
此外，两者的核算基础也有所不同。税务会计主要以收付实现制为核算基础，既操作简便，又可防止纳税人偷税漏税行为。而财务会计则以权责发生制为核算基础，以应收、应付作为确认收入费用的标准，能使收入费用恰当的配比，便于确定各期经营成果，使会计信息更加准确、相关和有用。
在核算对象方面，税务会计核算的对象是狭义的税务资金运动过程，即从纳税收入产生经营收入开始，到足额上缴税款为止的税务资金运动。而财务会计核算的则是企业全部的资金运动。
在核算程序上，税务会计没有规范化的要求，企业一般在期末借助于财务会计的数据资料，按照税法规定进行调整数据以编制纳税申报表。而财务会计规范化的程序是“会计凭证一会计账簿一会计报表”的顺序。
在会计要素上，税务会计的要素有四项，即应税收入、扣除费用、纳税所得(应税收益)和应纳税额。而财务会计则有六大要素，即资产、负债、所有者权益、收入、费用和利润。
最后，对于会计上的稳健原则态度也不同。税务会计一般不对未来损失和费用进行预计，只有在客观上证据表明已发生的情况下方可确认。而财务会计实行稳健原则，一般充分预计可能的损失和费用，而不预计可能的收入，使财务报表所反映的财务状况和经营成果不被报表使用者误解。