行政单位在财政直接支付方式下的支出会计分录如下：
首先，当行政单位根据收到的“财政直接支付入账通知书”及相关原始凭证时，会进行以下会计分录：借：经费支出；贷：财政拨款收入。
其次，如果财政直接支出部分的支出构成新增固定资产的，应同登记固定资产账。会计分录为：借：固定资产；贷：固定基金。
最后，到了年末，行政单位需要根据本年度财政直接支付预算指标数与财政直接支付实际支出数的差额进行调整。会计分录为：借：财政应返还额度—财政直接支付；贷：财政拨款收入。
这些会计分录反映了行政单位在财政直接支付方式下的收入和支出情况，以及如何调整年末的财政应返还额度。通过这些会计分录，行政单位可以更好地管理和控制其财务状况。