当公司支付员工房屋租金时，会计处理上需要将这部分费用计入预付账款科目进行核算。同时，由于这笔费用是用于员工的福利，因此还需要将其计入管理费用中的福利费科目。以下是具体的分录过程：
首先，公司支付房屋租金时，需要进行以下会计分录：
借：预付账款 应交税费—应交增值税—进项税额 贷：银行存款等
其次，在实际受益期间内，公司需要对这笔预付账款进行摊销。具体分录如下：
借：管理费用—福利费等 贷：预付账款
通过以上分录处理，公司可以将支付的房屋租金合理地计入到相关的会计科目中，并在实际受益期间内进行摊销。这样，既符合会计准则的要求，又能够准确地反映公司的财务状况和经营情况。