应付工程款在计提时，会计处理上会计入到在建工程科目，同时确认应付账款金额。待工程完工后，这部分款项将转入固定资产科目。具体的会计分录如下：
首先，借记“在建工程—XX工程”，以及“应交税费—应交增值税—进项税额”，贷记“应付账款”。
实际支付时，借记“应付账款”，贷记“银行存款”。
最后，当工程完工后，将款项从在建工程科目转入固定资产科目，借记“固定资产XX资产”，贷记“在建工程—XX工程”。
以上是应付工程款在计提、支付和完工后的会计处理流程。在实际工作中，企业需要根据具体情况进行操作，确保会计处理的准确性和合规性。