当员工工作服的款项在工资中扣除时，账务处理的方式是：
首先，我们需要借记应付职工薪酬—工资。这是因为员工工作服的费用将从员工的薪资中扣除，因此应付给员工的薪酬金额会减少。
其次，我们需要贷记其他应收款。这是因为员工工作服的费用是由公司支付的，所以公司需要将这笔费用计入其他应收款中。
通过这样的账务处理方式，我们可以清楚地记录员工工作服的费用对公司财务状况的影响。具体来说，这种处理方式会导致应付职工薪酬减少，从而减少了公司的负债。同时，由于其他应收款也减少了，这也反映了公司资产的减少。
总之，员工工作服款项在工资扣除的情况下，账务处理的方式是通过借记应付职工薪酬—工资和贷记其他应收款来记录。这种处理方式能够准确地反映公司财务状况的变化。