根据规定，企业在初次购买增值税税控系统专用设备时，支付的费用以及缴纳的技术维护费可以在增值税应纳税额中全额抵减。具体操作如下：
1. 对于一般纳税人，按照规定抵减的增值税应纳税额，需要借记“应交税费—应交增值税（减免税款）”科目。而小规模纳税人则应借记“应交税费—应交增值税”科目。
2. 在贷方，无论是一般纳税人还是小规模纳税人，都需要贷记“管理费用”等科目。
总结：企业初次购买增值税税控系统专用设备支付的费用以及缴纳的技术维护费允许在增值税应纳税额中全额抵减。一般纳税人应借记“应交税费—应交增值税（减免税款）”科目，贷记“管理费用”等科目；小规模纳税人应借记“应交税费—应交增值税”科目，贷记“管理费用”等科目。