管理会计和财务会计是会计学的两大分支，也是会计信息系统的基本子系统。管理会计是从财务会计中分离出来的，与财务会计并行的会计分支。尽管两者的信息源相同，计量单位甚至提供的财务信息也有相当的部分重叠，但两者的差别也十分明显。
首先，两者的使用者不同。财务会计的使用者多为外部机构或个人，比如股东、债权人、税务机关、银行等；而管理会计则为企业或组织内部各级管理人员乃至不同员工提供信息。
其次，两者使用的目的不同。财务会计主要利用资产负债表、利润表和现金流量表来报告企业过去期间内的经营业绩，其目的在于解释经营业绩，解脱可稽核责任。因为在现代企业管理中，管理者并非资本所有者，而资本所有者又不直接参与企业管理，因此，企业管理者必须披露财务报告描述资产动向及业绩结果。
此外，两者提供的信息时效也不同。财务会计信息是历史记录的汇总，而且推迟报告。例如，我国上市公司可以在会计年度结束四个月之内披露财务报告。而管理会计则提供当前和未来导向的信息，为决策提供及时的依据。
再者，两者的限制也不同。财务会计必须严格遵照外部权威机构制定的会计准则提供信息，目的是为了资本市场中潜在的投资者比较不同企业、不同行业的经营业绩和投资价值的需要。而管理会计信息多种多样，采取什么口径和方法不受外部权威机构限制，完全由企业自己根据企业具体情况和决策需要确定。
此外，两者提供的信息类型也不同。财务会计从产生开始就以货币为计量单位，提供单纯的财务信息。而管理会计从产生就同时提供财务与非财务信息，比如单位产品材料耗用量和单位产品工时就是降低及控制成本的重要信息的重要信息。
另外，两者的信息特征也不同。财务会计信息通常以客观、可集合、连贯和准确作为基本特征。而管理会计信息则包括更多的主观判断，但必须有效、相关和正确。这需要利用多种工具和专业方法。
最后，两者核算的范围也不同。从财务会计的角度来看，无论公司或集团有多大都被当成一个整体编制资产负债表利润表和现金流量表等三张报表，跨国公司也不例外。而从管理会计的角度来看，无论公司有多小都被当做一个有结构的整体并为该整体及其各个组成部分提供信息。例如预算可以为整个公司编制全面预算也可以为公司各个层级乃至个人编制预算并将这些预算的计划和责任以及相应的奖惩把公司和个人连接起来提供预算反馈信息。