商业企业主要需缴纳的印花税税目是购销合同，按照购销金额的万分之三进行缴纳。所谓的“计征总额”即是指购销金额。在某些地区，还会存在一些税收优惠政策，根据一定的比例来计算应缴税额。
需要缴纳印花税的凭证有以下几种：
首先，购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证，这些都属于应纳税的凭证。
其次，产权转移书据也需要缴纳印花税。
此外，营业账簿也是需要缴纳印花税的。
权利、许可证照同样属于应纳税的凭证。
最后，经财政部确定征税的其他凭证也需要缴纳印花税。
以上便是商业企业在缴纳印花税时需要注意的事项。