当企业需要填写增值税申报表时，可以按照以下步骤进行操作：
1. 首先，企业应正常填入一般情况下的申报数据。这包括企业的基本信息、销售额、进项税额等相关数据。
2. 接下来，企业需要填入增值税申报表附表四中的最下面表二，即加计扣除的部分。在这个表格中，企业需要在本期发生额中填入相应的抵减金额。这些抵减金额可能包括企业购买固定资产所支付的增值税等。然后，企业还需要填写本期实际想用的抵减额，并进行保存。
3. 完成加计扣除部分的填写后，企业可以回到增值税申报主表。在主表中，企业可以看到系统自动计算了抵减后的应纳税额。此时，企业只需点击保存、申报和缴税按钮，即可完成增值税申报的过程。
需要注意的是，企业在填写增值税申报表时，应严格按照规定的要求进行操作，确保数据的准确性和完整性。此外，如果企业有特殊情况或需要申请税收优惠，应及时向税务部门咨询并提供相关证明材料。只有正确填写和及时申报增值税，企业才能合法合规地履行纳税义务，避免不必要的税务风险。