当需要支付的支票或票据尚未支付时，首先应进行挂失并暂停支付。若用于做账的付款凭证已丢失，以下是相应的处理方式：
1. 如果丢失的部分可以自制原始凭证，您可以重新制作原始凭证，并从系统中再次打印整理好记账凭证。这种情况下，这是公司内部的管理责任问题。
2. 如果丢失的是发票记账联，可以根据公司的存根联进行复印，并从系统中再次打印整理好记账凭证。
3. 如果是发票联：根据《国家税务总局关于增值税发票综合服务平台等事项的公告》（国家税务总局公告2020年第1号）第四条规定：
（1）如果丢失的是增值税专用发票的发票联，可以将专用发票抵扣联复印件作为入账及税前扣除凭证；如果丢失的是抵扣联，可以将专用发票发票联复印件作为入账及税前扣除凭证；如果发票联和抵扣联都丢失了，可以凭销售方提供的加盖销售方发票专用章的相应发票记账联复印件作为入账及税前扣除凭证。
（2）如果丢失的是增值税普通发票，可以参照上述专票的方式处理。如果无法取得复印件的普票丢失，可以依照财政部2019年98号令55条进行处理，通常是取得发票复印件。但关于税前扣除，需要与税务局核实。
4. 如果是银行单据丢失的，可以联系相应的银行补打银行回单。