发票抬头和付款抬头不一致是否可以，要具体情况进行分析。
首先，如果是总分公司性质的公司，需要能够搞清原因，这种情况下是可以允许发票抬头和付款抬头不一致的。这是因为总分公司之间存在着紧密的业务联系和财务往来，发票抬头和付款抬头的不一致可能是由于内部调整或者特定的业务需求所导致的。在这种情况下，只要能够提供充分的情况说明，并确保相关交易的准确性和合规性，就可以接受发票抬头和付款抬头不一致的情况。
然而，如果发票抬头和付款抬头的两个公司没有业务往来，直接按照不一致的情况处理是不可以的。在这种情况下，发票抬头和付款抬头的不一致可能会引发财务纠纷和风险。为了确保交易的透明度和合规性，建议在发票抬头和付款抬头上保持一致，避免可能的法律和财务风险。
但是，如果存在特殊情况，可以写一个情况说明备查，这样的情况下也是可以接受的。例如，如果发票抬头和付款抬头不一致是由于系统错误或者临时调整所导致的，并且能够提供详细的情况说明和相关的支持文件，那么可以暂时接受这种不一致的情况。但是，在这种情况下，必须确保及时纠正错误，并在后续的交易中保持一致。
总之，发票抬头和付款抬头是否可以不一致需要根据具体情况进行分析。对于总分公司之间的业务往来，可以允许发票抬头和付款抬头不一致；而对于没有业务往来的两个公司，应该保持发票抬头和付款抬头的一致性。在特殊情况下，可以通过提供情况说明来解决问题，但必须确保及时纠正错误并保持一致。