合伙企业增值税计算方法如下：
1. 一般计税方法适用于一般纳税人。 2. 在一般计税方法下，当期应纳增值税等于当期销项税额减去当期进项税额。 3. 如果当期销项税额小于当期进项税额，不足抵扣的部分可以结转下期继续抵扣。
对于小规模纳税人，其季度开具的增值税普通发票加专用发票销售额不超过45万元时，普通发票不需要缴纳增值税，而专票则根据发票上的税额缴纳增值税。
然而，如果销售额超过45万元，则全额缴纳增值税。
需要注意的是，以上内容仅为简要介绍，实际计算过程中可能涉及到更多的细节和特殊情况。因此，建议在具体操作中参考相关税法法规和税务机关的规定，以确保计算的准确性和合规性。