一般情况下，当可供出售金融资产发生减值时，其会计分录可以表示为：借记“资产减值损失”，贷记“其他综合收益”和“可供出售金融资产—公允价值变动”。其中，“资产减值损失”科目的金额等于减值时的公允价值减去减值时的摊余成本；“其他综合收益”科目的金额等于可供出售金融资产累计公允价值变动额；“可供出售金融资产—公允价值变动”等于减值时的公允价值减去减值前的账面价值。
在某些情况下，如果减值前账面价值大于初始成本（此时相关资本公积为贷方余额），由于特殊原因导致公允价值急剧下降并发生减值，这时需要将资本公积的贷方数从借方转出。这种情况下的会计分录为：借记“资产减值损失”和“其他综合收益”，贷记“可供出售金融资产—公允价值变动”。
需要注意的是，在确认可供出售金融资产减值后，如果以后期间价值回升，一般是可以转回的。具体来说，可供出售权益工具的减值损失不得通过损益转回，转回的分录为：借记“可供出售金融资产—公允价值变动”，贷记“其他综合收益”；而可供出售债务工具的减值损失则可以通过以下分录转回：借记“可供出售金融资产—公允价值变动”，贷记“资产减值损失”。