行政单位工资的会计分录包括财政直接支付和财政授权支付业务。在预算会计中，借：行政支出、事业支出等科目，贷：财政拨款预算收入。同时在财务会计中，借：应付职工薪酬，贷：财政拨款收入。
年末，根据本年度财政直接支付预算指标数与其实际支出数的差额，在预算会计中：借：资金结存一财政应返还额度，贷：财政拨款预算收入。同时在财务会计中，借：财政应返还额度，贷：财政拨款收入。
财政授权支付业务包括在预算会计中的借：资金结存一零余额账户用款额度，贷：财政拨款预算收入。同时在财务会计中，借：零余额账户用款额度，贷：财政拨款收入。
按规定支用额度时，按照实际支用的额度，在预算会计中：借：行政支出、事业支出等，贷：资金结存一零余额账户用款额度。同时在财务会计中，借：库存物品、固定资产、应付职工薪酬、业务活动费用、单位管理费用等，贷：零余额账户用款额度。
年末，依据代理银行提供的对账单作注销额度的相关账务处理。在预算会计中，借：资金结存一财政应返还额度，贷：资金结存—零余额账户用款额度。同时在财务会计中，借：财政应返还额度一财政授权支付，贷：零余额账户用款额度。