辅助生产车间的管理人员工资应计入制造费用科目进行核算。制造费用指企业为生产产品和提供劳务而发生的各项间接费用，包括企业生产部门（如生产车间）发生的水电费、固定资产折旧、无形资产摊销、管理人员的职工薪酬、劳动保护费、国家规定的有关环保费用、季节性和修理期间的停工损失等。
具体会计分录如下：
借：制造费用 贷：应付职工薪酬
期末再结转到生产成本：
借：生产成本 贷：制造费用—工资
实际支付时：
借：应付职工薪酬 贷：库存现金/银行存款。