当企业实际收到的货物价值大于已付的金额，或者企业已经支付了部分货款，需要补付剩余货款金额时，可以按照以下步骤进行会计处理。
首先，将补付的部分计入到应付账款进行核算。具体的分录如下：
借：库存商品等 应交税费—应交增值税—进项税额 贷：预付账款 银行存款等
在这个分录中，借方表示增加资产或负债，贷方表示减少资产或负债。
借方的第一项是库存商品等，表示企业收到了实际价值大于已付金额的货物。这些货物将成为企业的资产。
借方的第二项是应交税费—应交增值税—进项税额，表示企业需要支付的增值税。这部分税款将根据实际收到的货物价值计算得出。
贷方的第一项是预付账款，表示企业已经支付了部分货款。这部分款项将用于抵扣实际收到的货物价值。
贷方的第二项是银行存款等，表示企业通过银行或其他渠道支付了剩余的货款。
通过以上分录，企业可以准确地记录实际收到的货物价值和已付的金额，以及需要补付的剩余货款金额。这样可以避免财务记录的错误和混乱，确保企业的财务状况准确无误。