企业合并会计分录主要涉及到两种情况：同一控制下的企业合并和非同一控制下的企业合并。
对于同一控制下的企业合并，如果合并方以支付现金、转让非现金资产或承担债务方式作为合并对价，则相应的会计分录为：借记长期股权投资，贷记长期借款等、现金等，以及资本公积—资本溢价或股本溢价（差额，可能在借方）。同时，支付的费用做如下分录：借记管理费用，贷记银行存款。如果合并方以发行权益性证券作为合并对价，则相应的会计分录为：借记长期股权投资，贷记股本（发行股票的数量×每股面值），以及资本公积—股本溢价（差额）。同时，支付的发行费用做如下分录：借记资本公积—股本溢价，贷记银行存款。
对于非同一控制下的企业合并，总原则是：长期股权投资=付出对价的公允价值。具体分录根据不同的合并对价有所不同。例如，用存货进行投资时，借记长期股权投资（公允价值：含税价）、应收股利，贷记主营业务收入/其他业务收入、应交税费—应交增值税（销项税额）；同时，借记主营业务成本/其他业务成本，贷记库存商品/原材料。另外，固定资产投资、以长期股权投资、交易性金融资产、以公允价值计量且其变动计入其他综合收益的债券性金融资产作为合并对价等情况下，也有相应的会计分录。
总之，企业合并会计分录需要根据具体情况进行判断和处理，确保财务报表的准确性和合规性。