电子会计凭证的归档及管理需遵循《会计档案管理办法》（财政部国家档案局第79号令）等相关规定。
一、电子会计凭证是指单位接收的各类电子形式的会计凭证，包括电子发票、财政电子票据、电子客票、电子行程单、电子海关专用缴款书、银行电子回单等。
二、来源合法、真实的电子会计凭证与纸质会计凭证具有同等法律效力。
三、在满足以下条件的情况下，单位可以使用电子会计凭证进行报销入账归档： 1. 接收的电子会计凭证经查验合法、真实； 2. 电子会计凭证的传输、存储安全、可靠，对电子会计凭证的任何篡改能够及时被发现； 3. 使用的会计核算系统能够准确、完整、有效接收和读取电子会计凭证及其元数据，能够按照国家统一的会计制度完成会计核算业务，能够按照国家档案行政管理部门规定格式输出电子会计凭证及其元数据，设定了经办、审核、审批等必要的审签程序，且能有效防止电子会计凭证重复入账； 4. 电子会计凭证的归档及管理符合《会计档案管理办法》（财政部国家档案局第79号令）等要求。
四、单位以电子会计凭证的纸质打印件作为报销入账归档依据的，必须同时保存打印该纸质件的电子会计凭证。
五、符合档案管理要求的电子会计档案与纸质档案具有同等法律效力。除法律、行政法规另有规定外，电子会计档案可不再另以纸质形式保存。
六、单位和个人在电子会计凭证报销入账归档中存在违反本通知规定行为的，县级以上人民政府财政部门、档案行政管理部门应当依据《中华人民共和国会计法》《中华人民共和国档案法》等有关法律、行政法规处理处罚。