根据《企业所得税法实施条例》（国务院令第512号）第三十九条的规定，企业在货币交易中以及在纳税年度结束时将人民币以外的货币性资产和负债按照期末即期人民币汇率中间价折算为人民币时产生的汇兑损失，除已经计入有关资产成本以及与向所有者进行利润分配相关的部分外，准予扣除。
因此，若企业所得税征收方式为查账征收，企业发生的汇兑损失应按上述文件规定处理。这意味着，企业在进行货币交易或在纳税年度结束时，需要将人民币以外的货币性资产和负债按照期末即期人民币汇率中间价折算为人民币。在这个过程中，可能会产生一些汇兑损失。
对于这些汇兑损失，企业可以将其扣除，但有一些限制。首先，只有已经计入有关资产成本以及与向所有者进行利润分配相关的部分才能被扣除。其次，如果企业所得税的征收方式为查账征收，那么企业发生的汇兑损失必须按照上述文件的规定进行处理。
总之，根据《企业所得税法实施条例》第三十九条的规定，企业在货币交易中以及在纳税年度结束时将人民币以外的货币性资产和负债按照期末即期人民币汇率中间价折算为人民币时产生的汇兑损失，除已经计入有关资产成本以及与向所有者进行利润分配相关的部分外，准予扣除。