事业单位在财务上通常具有双重性质，一方面享有财政经费拨款，另一方面也有一定的经营收入。根据《企业所得税法》和《企业所得税法实施条例》的相关规定，这类既有财政经费拨款，又有经营收入的事业单位被认定为差额预算单位，因此需要按照企业所得税的相关规定缴纳税款。
具体来说，在企业所得税汇算清缴的过程中，除了填报主表外，事业单位还需要填报《事业单位、社会团体、民办非企业单位收入项目明细表》等相关表格。这些表格详细记录了单位的各类收入项目，包括财政拨款、经营收入等，有助于税务部门对单位的财务状况进行准确评估。
此外，事业单位在缴纳企业所得税时，还需注意以下几点：
1. 区分不同类型的收入：事业单位的收入来源可能包括财政拨款、事业收入、经营收入等，不同类型收入的税收政策可能有所不同，因此在计算应纳税所得额时，要确保正确区分并适用相应的税收政策。
2. 合理确定成本费用：事业单位在计算应纳税所得额时，需要扣除与生产经营活动有关的成本费用。合理确定成本费用，有助于降低应纳税所得额，从而减轻税收负担。
3. 做好税收筹划：事业单位在经营活动中，可以通过合理的税收筹划，如享受税收优惠政策、合理安排资产折旧等，降低税收负担，提高经济效益。
4. 加强税收风险管理：事业单位在缴纳企业所得税过程中，要加强税收风险管理，确保税收申报、缴纳等环节的合规性，避免因税收问题引发法律纠纷。
总之，作为差额预算单位的事业单位，在享受财政经费拨款的同时，也需要承担一定的税收责任。通过合理规划税收，事业单位可以在保障正常运营的同时，有效降低税收负担，提高经济效益。