银行存款的清查方法主要包括账目核对，具体包括以下步骤：
首先，进行日记帐与总帐的核对。这是为了确保两者的数据一致性，任何差异都需要进一步调查和解决。
其次，核对日记帐与收付款凭证。这是因为收付款凭证是记录企业资金流动的重要文件，需要定期检查以确保其准确性。
接下来，将日记帐与对帐单进行对比。对帐单是银行提供的文件，用于记录企业的存款和取款情况，因此，它的准确性对于银行存款的清查至关重要。
最后，总分类帐和收付款凭证也需要进行核对。这可以确保企业在处理财务事务时的一致性和准确性。
此外，银行对账也是银行存款清查的重要环节。这个过程是将银行存款日记账的账面余额与开户银行转来的对账单的余额进行核对，以查明账实是否相符。如果银行存款日记账与开户银行转来的对账单不一致，可能的原因有两个：一是双方或一方记账有错误，二是存在未达账项。
未达账项是由于企业与银行的记账时间不一致，而发生的一方已取得凭证登记入账，另一方由于未取得凭证尚未登记入账的项目。具体包括以下四种情况：企业已收款入账，银行尚未收款入账；企业已付款入账，银行尚未付款入账；银行已收款入账，企业尚未收款入账；银行已付款入账，企业尚未付款入账。