股权转让会计分录的处理方法如下：
首先，根据股权转让协议入账。此时，借方应记录为“实收资本-原股东”，贷方应记录为“实收资本-新股东”。这一步骤是为了反映公司股权从原股东向新股东的转移。
其次，当新股东通过公司账户交款时，会计分录应为：借记“银行存款（库存现金）”，贷记“其他应付款-代收股权转让款”。这一步骤是为了反映新股东支付的款项以及公司代收的股权转让款。
接下来，支付给原股东的款项，会计分录应为：借记“其他应付款-代收股权转让款”，贷记“银行存款（库存现金）”。这一步骤是为了反映公司将代收的股权转让款支付给原股东。
最后，需要注意的是，如果转股双方涉及个人，税金应由个人自己负担。单位帮助申报是代扣代缴。这一步骤是为了确保税费的正确处理，遵守相关法律法规。
综上所述，股权转让会计分录的处理包括入账、新股东交款、支付给原股东以及税费处理等几个步骤。在进行会计分录时，需要按照相关准则和规定进行操作，确保准确记录和反映股权转让的经济业务。