往来款的预算会计分录是新政府会计制度规定的重要内容。根据这一规定，自2019年起，机关事业单位在进行财务会计账务处理的同时，也需要进行预算会计账务处理。
在预算会计中，货币资金相关科目的处理需要遵循平行记账的原则。这意味着，当涉及到财务会计中的货币资金相关科目时，需要在预算会计中进行相应的平行记账操作。这样做可以确保预算会计和财务会计之间的一致性，提高会计信息的准确性和可靠性。
然而，在实际处理过程中，也存在一些特殊情况。对于往来款来说，不需要进行平行记账。这是因为往来款的特殊性质决定了其与货币资金相关科目之间的关系并不直接。往来款通常涉及到单位与外部实体之间的经济交易，而货币资金则主要涉及单位内部的资金流动。
因此，在处理往来款的预算会计分录时，可以根据实际需要进行相应的确认收入和支出。这样可以避免不必要的平行记账操作，提高会计处理的效率和准确性。
总之，往来款的预算会计分录需要根据新政府会计制度的规定进行。在一般情况下，涉及到财务会计中的货币资金相关科目需要进行平行记账。然而，对于往来款来说，由于其特殊性质，不需要进行平行记账。实际确认收入和支出时，可以根据需要进行相应的处理。这样可以确保预算会计和财务会计之间的一致性，提高会计信息的准确性和可靠性。