首先，将年终奖除以12，得到的商数用于确定适用的税率及速算扣除数。接着，使用全年一次性奖金乘以所选税率再减去速算扣除数来计算个人所得税。若当月工资低于5000元，则需从年终奖中扣除与5000元的差额，然后按照上述方法进行计算。