当个人独资企业的生产经营所得个税由企业代为申报和缴纳时，该笔税款应记录在“其他应付款—代扣个人所得税”会计科目中。具体的会计处理步骤如下：

首先，从利润分配账户借记未分配利润，表示这部分资金将用于支付税款。

然后，贷记“其他应付款—代扣个人所得税”，反映企业已承担了代扣代缴的义务。

接着，再进行一笔借贷操作，即借记“其他应付款—代扣个人所得税”，此时意味着企业正在使用这笔款项来履行其税务责任。

最后一步是贷记“银行存款”，表明实际支付给税务机关的现金或转账已经完成。