处理招标过程中收取投标单位的标书费用的会计操作如下：

1. 当企业收到投标单位的标书费时，

借记：库存现金或银行存款，

贷记：其他业务收入，

同时，贷记：应交税费—应交增值税—销项税额。

2. 支付与标书相关的费用，

借记：其他业务成本，

贷记：银行存款等。

3. 对于支付给相关人员的奖励，

首先，借记：应付职工薪酬—工资，

贷记：银行存款等。

然后，再次借记：其他业务成本，

贷记：应付职工薪酬—工资。