当新公司收到款项但尚未开具发票时，应将这笔款项先记录在“预收账款”科目中。具体的会计处理如下所示：

借方：银行存款

贷方：预收账款

一旦企业完成发票的开具并确认了收入，例如在销售商品的过程中，相关的会计分录将变为：

借方：预收账款

贷方：主营业务收入

贷方：应交税费—应交增值税（销项税额）

此外，还需要结转销售成本，其对应的会计分录如下：

借方：主营业务成本

贷方：库存商品