总公司与分公司之间的资金流动，通常被记录在内部往来账目中。所谓内部往来，指的是企业总部与其下属各独立核算单位之间，或是这些单位相互之间，因工程款项结算、产品销售、服务提供等业务活动而产生的各类应收应付款项。例如，当分公司从总公司获得一笔借款时，其会计处理如下：
借记银行存款账户； 贷记内部往来—总公司账户。