当企业购入商品时，所支付的运费应计入商品的采购成本。以下是具体的会计处理流程：

首先，记录购进商品的成本和相关的税费。

借方：库存商品/原材料（购买价格 运费），

应交税费—应交增值税（进项税额），

贷方：银行存款。

此外，存货的采购成本不仅包括购买价款，还涵盖了运输费、装卸费、保险费及其他与采购直接相关的各项费用。