员工商业保险费用应该计入福利费用里面，根据有关规定，对个人购买符合规定的商业健康保险产品的支出，允许在当年(月)计算应纳税所得额时予以税前扣除，扣除限额为2400元/年(200元/月)。单位统一为员工购买符合规定的商业健康保险产品的支出，应分别计入员工个人工资薪金，视同个人购买，按上述限额予以扣除。其会计分录如下：

借：管理费用—福利费 ，

贷：应付职工薪酬 ，

借：应付职工薪酬 ，

贷：银行存款。