已经抵扣认证的发票需要作废时，需要通过开具红字发票进行操作。

收票方需在开票软件中，提交开具红字发票的申请，将申请交给开票方。由开票方开具红字发票；收票方收到开票方开具的红字发票后，做进项税转出处理，收票方根据开票方开出正确的发票，进行记账与纳税申报。