大额医疗保险在填写个税申报表时，不是填写在基本医疗保险那一格，而是填写在个人所得税自行纳税申报表（A表）中的其他扣除项中的""其它""栏中。在个人所得税扣缴申报表中填写在""其它扣除""中的""商业健康保险""栏。

不过需要提醒的是，不是所有的大额医疗保险都允许扣除，只有属于符合条件的商业保险才允许扣除。