公司员工退回多发放的工资时，需要根据实际情况来确认，如果企业工资本身没有计算错误，会计分录也没有错，只是在发放的时候多发了，这种情况下，退回多发的工资即可，如果企业多计提导致多发的，则需要冲减多计提的部分，并将发放时多发放的金额冲回。