包头市区二手房贷款的办理流程是：

1、首先买卖双方需要签署二手房买卖协议，付清首付款或办理资金托管协议。

2、然后买房者携带二手房申请材料到银行办理贷款业务，在银行填写房屋贷款申请表。

3、然后等待银行对房贷贷款进行审批。

4、银行放款至托管中心。

5、办理产权过户等相关手续。