企业销售软件所适用的税率按企业的性质不同分为如下两种，一种是一般纳税人，其对应税率为13%，一种是小规模纳税人，其适用税率为3%或者1%。另外，软件销售企业增值税一般纳税人销售其自行开发生产的软件产品，按13%税率征收增值税后，对其增值税实际税负超过3%的部分实行即征即退政策。