一般来说不影响。内部科目互换。盈余公积补亏是指将盈余公积里的钱转移到未分配利润里，盈余公积少了，未分配利润就多了，企业就可能出现扭亏情况，但是总量留存收益不变。

盈余公积作用其中之一就是弥补亏损，弥补亏损的渠道主要有三种：以后年度税前利润弥补，以后年度税后利润弥补，盈余公积弥补亏损。企业提取盈余公积弥补亏损时，应当由公司董事会提议，并经股东大会批准。