北京的住房公积金贷款和商贷的区别有：

1、贷款的对象不同：商贷不限对象，公积金只对缴存过的对象办理。

2、贷款权限不同：商贷不限，公积金贷款局限于缴存所在地贷款或者政策允许条件下的异地贷款。

3、贷款成数不同：公积金贷款的首付都可以付到3成，虽然住房商业贷款也可以付到3成，但各家商业银行还存在一些其他的政策来限定比例。