收取员工罚款主要通过营业外收入科目进行核算，具体的账务处理如下：
发放工资时，同时扣除罚款金额。在会计分录中，借方是应付职工薪酬—应付职工工资，贷方是其他应收款—罚款和银行存款。
当罚款结转到营业外收入时，会计分录中的借方是其他应收款—罚款，贷方是营业外收入。
以上是收取员工罚款的账务处理方式。