当单位从员工工资中扣除借款时，账务处理如下：
首先，借方需要增加应付职工薪酬—工资。这是因为扣款会导致应付职工薪酬减少，从而减少了公司的负债。因此，在借方中记录这一变化是合理的。
其次，贷方需要增加其他应收款。这是因为扣款会导致其他应收款减少，即员工的个人借款减少。因此，在贷方中记录这一变化是合理的。
综上所述，单位从员工工资中扣除借款时，账务处理如下：
借：应付职工薪酬—工资 贷：其他应收款
这样的处理方式能够准确地反映出公司负债和资产的变化情况。同时，这种账务处理方法也符合会计准则的规定，确保了财务数据的准确性和可靠性。