在发放员工工资时，企业需要扣除员工的社保缴纳部分。具体账务处理如下：
首先，企业需要计提工资。这一步的操作是：借记管理费用—工资，贷记应付职工薪酬—工资。
其次，企业需要发放工资。这一步的操作是：借记应付职工薪酬—工资，贷记银行存款。
接着，企业需要扣除员工的个人社保。这一步的操作是：借记其他应付款—个人社保。
然后，企业需要扣除员工的个人所得税。这一步的操作是：借记应交税费—个人所得税，贷记银行存款。
接下来，企业需要计提社保。这一步的操作是：借记管理费用—社保单位，贷记应付职工薪酬—社保单位。
最后，企业需要缴纳社保。这一步的操作是：借记应付职工薪酬—社保单位，其他应付款—个人社保，贷记银行存款。