自然灾害对企业造成的损失会计入营业外支出科目。
营业外支出是指企业发生的与其日常活动无直接关系的各项损失。具体包括以下几个方面：
1. 非流动资产毁损报废损失：指因自然灾害等发生毁损、已丧失使用功能而报废非流动资产所产生的清理损失。
2. 捐赠支出：企业进行的慈善捐赠所产生的费用。
3. 盘亏损失：经批准计入营业外支出的盘亏损失。
4. 非常损失：由自然灾害等原因导致的非常损失。
5. 罚款支出：包括行政罚款、税务罚款，以及其他违法或违背合同而支付的罚款、违约金、赔偿金等。
6. 债务重组损失：企业在进行债务重组过程中所发生的各种损失。
通过将这些损失计入营业外支出科目，企业能够更准确地反映其财务状况和经营业绩。这也有助于监管部门和投资者更好地了解企业的经济状况，从而做出更明智的决策。同时，企业也应该加强对自然灾害等不可抗力因素的风险管理，以减少由此造成的损失。