企业实际支付的代理费，需要根据具体的项目，计入到对应的科目，如果是增值税专用发票，则需要确认对应的进项税额。比如：

借：管理费用—代理服务费费等，

应交税费—应交增值税—进项税额，

贷：应付账款—xx公司。